1984年9月、偉大な教育者であった齋藤秀雄氏の没後10年に、彼の教え子であった指揮者小澤征爾の発案により、秋山和慶ら門下生100余名が、メモリアルコンサートを開催した。サイトウ・キネン・オーケストラ（SKO）はこれが基礎となって生まれたオーケストラである。

1987年に第1回、1989年には第2回ヨーロッパ・ツアーが行われ、ウィーンやベルリンなどの音楽の都で「ウィーン・フィルやベルリン・フィルに並ぶ音を出す、小澤とともにやって来た驚異的なオーケストラ」と絶賛された。1990年に小澤征爾の指揮によってザルツブルク・フェスティバルを始めとするヨーロッパ各地のフェスティバルに招かれ、1991年 ロンドン、デュッセルドルフ、アムステルダム、ニューヨークの世界ツアーを実施。1992年に長野県松本市をSKOの本拠地とし「セイジ・オザワ 松本フェスティバル」（旧サイトウ・キネン・フェスティバル松本）が開幕。以降、毎年世界から注目されるオペラ公演やコンサート公演を開催している。

SKOのメンバーは、ヨーロッパ、アメリカ、日本のメジャーオーケストラの主要メンバー、ソリスト、室内楽演奏者、教育者として世界中で活躍しており、国際的なコンクールの入賞者も多い。それぞれの音楽家が個性豊かな音楽性を持ちながらも、SKO への参加を通じ、オザワ・スピリットとも言える音楽に対する姿勢、精神が培われ、まるで一つの生き物のようになる。その類稀なる特色は次世代の若手音楽家たちにも受け継がれ、このオーケストラは世界で際立った存在感を示している。

SKO は今まで数多くのレコーディングを発表しており、2016年には第58回グラミー賞最優秀オペラ録音賞（小澤征爾指揮／ラヴェル「子どもと魔法」他）を受賞した。